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移液之前，要保證移液器、槍頭和液體處于相同溫度。吸取液體時，移液器保持豎直狀態，將槍頭插入液面下2－3毫米。在吸液之前，可以先吸放幾次液體以潤濕吸液嘴（尤其是要吸取粘稠或密度與水不同的液體時）。這時可以采取兩種移液方法。
一是前進移液法。用大拇指將按鈕按下至第一停點，然后慢慢松開按鈕回原點。接著將按鈕按至第一停點排出液體，稍停片刻繼續按按鈕至第二停點吹出殘余的液體。最后松開按鈕。
二是反向移液法。此法一般用于轉移高粘液體、生物活性液體、易起泡液體或極微量的液體，其原理就是先吸入多于設置量程的液體，轉移液體的時候不用吹出殘余的液體。先按下按鈕至第二停點，慢慢松開按鈕至原點。接著將按鈕按至第一停點排出設置好量程的液體，繼續保持按住按鈕位于第一停點（千萬別再往下按），取下有殘留液體的槍頭，棄之。
使用完畢，可以將其豎直掛在移液槍架上，但要小心別掉下來。當移液器槍頭里有液體時，切勿將移液器水平放置或倒置，以免液體倒流腐蝕活塞彈簧。
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